В целях концентрации средств на наиболее приоритетных объектах работы по строительству и реконструкции очистных сооружений велись на основе соглашений о долевом финансировании департамента с администрациями районов. В 1999 году, в соответствии с распоряжением губернатора области от 05.02.99 № 155-р, было заключено 10 таких соглашений (с администрациями г.Арзамаса, Первомайского, Городецкого, Ковернинского, Вачского, Воскресенского, Большеболдинского, Спасского, Сокольского, Выксунского районов). Соглашениями предусматривается, что заказчика на выполнение работ определяет администрация района (города), выбор подрядчика осуществляется на конкурсной основе.

В декабре 1999 г. построен узел биологической очистки, входящий во второй пусковой комплекс очистных сооружений г. Городца, ведется комплексное опробование технологической линии по очистке 17 тыс.куб.м/сут. стоков.

Осуществляется пуско-наладка на очистных сооружениях в санатории "Городецкий", однако в 1999 году из-за ряда просчетов в проектных решениях очистные сооружения не выведены на проектный режим работы.

Пущены в эксплуатацию после реконструкции аэротенки на очистных сооружениях канализации в г.Арзамасе, обеспечивающих очистку 32 тыс.куб.м/сут. стоков.

Проводились работы по строительству первого пускового комплекса очистных сооружений в г.Первомайске (готовность технологической линии на 31.12.99 составила 90%, готовность первого пускового комплекса очистных сооружений составляет примерно 80%). Строительно-монтажные работы на технологической линии завершены, проведены гидроиспытания емкостных конструкций.

В рабочих поселках Ковернино и Вача продолжается строительство очистных сооружений - подготовлены строительные площадки, ведется монтаж внутриплощадочных коммуникаций.

Продолжаются работы:

• по реконструкции очистных сооружений в р.п.Перевоз, Сосновское, Сатис Дивеевского района, ОАО "Линдовская птицефабрика" (Борский район), АО "Вермани" (Н.Новгород);
• по реконструкции сетей канализации курортного поселка "Зеленый город";
• по ремонту биологических очистных сооружений ОАО "Нормаль" (Шатковский район);
• по строительству очистных сооружений ОАО "Янтарь" в с.Б.Болдино, детского областного санатория "Солнечная поляна" (Дивеевский район), в п.Саваслейка Кулебакского района.

Проведен конкурс по определению генерального подрядчика по строительству очистных сооружений р.п. Дальнее Константиново, начаты работы по проектированию.

В 1999 году проводился ремонт потенциально опасных гидротехнических сооружений в Тоншаевском районе, а также ремонт водоспусков на озере Вадское.

За счет средств МУП "Водоканал" проведена санация 2,5 км канализационных труб в г.Н.Новгороде на сумму 5,2 млн.руб.

После издания распоряжения губернатора области от 08.02.99 № 170-р "Об утверждении методики расчетов платы за размещение плавательных средств, выведенных из эксплуатации, порядка взимания и внесения указанных платежей" в акватории Волги и Оки было поднято и отправлено на переплав 25 ржавеющих судов.